手術中醫生使用特殊的壓平錐鏡將病人角膜壓平，以保持雷射發射端到角膜組織中雷射聚焦點的精確距離。雷射脈衝發射到角膜組織後，在聚焦點將組織氣化成水泡和CO2氣 泡，水泡和氣泡被組織吸收後留後下微小空隙，角膜組織因此分離。 此外，雷射光只作用在距焦點，其光束經過的結構不受雷射光影響。